一、了解相关法律法规

在虹口经济开发区进行公司注销，首要之务是深入了解相关的法律法规。包括但不限于《中华人民共和国公司法》、《中华人民共和国税收法》等，这些法规对于公司注销的程序、条件、资料要求等都有详细规定。

在注销过程中，公司需要严格遵守这些法规，以确保注销程序的合法性和合规性。例如，在注销前需要履行清算程序，将公司的债务清偿完毕；在提交注销申请时，必须提供符合法定要求的相关资料。

此外，对于特定行业的公司，还需要了解该行业的监管政策和规定，以确保在注销过程中不会触犯相关规定。

二、完善内部程序

公司注销是一项繁琐的程序，需要经过多个部门和环节的协调配合。因此，公司需要完善内部的注销程序，明确各个部门的职责和任务。

在内部程序上，可以设立专门的注销小组或工作组，负责协调公司内部各个部门之间的沟通和协作。同时，制定详细的注销流程和时间表，确保每个环节都能够按时完成。

此外，公司还应建立健全的档案管理制度，妥善保存公司的相关资料和文件，以备在注销过程中使用。

三、咨询专业机构或律师

为了确保注销程序的合法合规，公司可以咨询专业的机构或律师。这些专业人士具有丰富的经验和专业知识，能够为公司提供专业的法律意见和建议。

在咨询过程中，公司可以就注销程序的具体细节和法律风险进行深入讨论，以找到最合适的解决方案。律师或专业机构还可以协助公司准备相关的文件和资料，确保其符合法定要求。

通过咨询专业机构或律师，可以有效降低公司在注销过程中的法律风险，保障公司的合法权益。

四、与相关部门沟通合作

在注销过程中，公司需要与相关部门进行沟通合作，共同完成注销手续。这些部门包括但不限于工商局、税务局、银行等。

在与相关部门沟通合作时，公司需要及时了解最新的政策和规定，确保自己的注销手续能够符合要求。同时，也要积极配合相关部门的工作，提供所需的资料和信息。

通过与相关部门的沟通合作，可以加快公司注销的进程，减少不必要的麻烦和延误。

综上所述，要确保在虹口经济开发区进行公司注销的程序合法合规，公司需要从多个方面着手。首先要深入了解相关法律法规，制定符合法定要求的注销程序；其次要完善内部程序，建立健全的内部管理制度；同时要咨询专业机构或律师，获取专业的法律意见和建议；最后要与相关部门进行沟通合作，共同完成注销手续。只有这样，公司才能够顺利完成注销程序，保障自己的合法权益。