在虹口经济开发区注册工程公司后，财务报表的编制和审计是确保企业财务健康和合规性的重要环节。本文将从多个方面详细阐述在这一过程中的关键步骤和注意事项。

一、法律法规遵从

首先，公司需要严格遵守虹口经济开发区及中国相关的法律法规，如《中华人民共和国企业会计准则》等，确保财务报表的编制符合法定要求。此外，应当密切关注相关法规的变化，及时调整财务报表编制和审计的流程，以确保合规性。

二、会计政策确定

其次，公司需要确定适用的会计政策，包括会计估计和会计确认方法等。针对工程公司的特点，可能涉及到合同收入确认、长期合同履约成本的核算等特殊会计政策，需要充分考虑行业实践和监管要求。

三、内部控制建立

建立健全的内部控制是财务报表编制和审计的关键环节。公司应当建立完善的内部控制制度，包括财务流程、审批权限、风险管理等方面，确保财务报表的准确性和完整性。

四、财务数据收集和整理

在财务报表编制过程中，需要对财务数据进行收集和整理。这包括收集公司各项业务的原始凭证，如销售发票、采购订单等，以及对这些数据进行分类、汇总和整理，以便后续编制财务报表。

五、审计程序执行

审计程序的执行是保证财务报表审计有效进行的关键步骤。审计师需要根据公司的内部控制情况和风险评估结果，制定相应的审计程序，并在实施过程中进行适当调整和完善，以保证审计的全面性和可靠性。

六、财务报表披露

最后，财务报表的披露是公司对外沟通财务信息的重要渠道。公司需要根据法律法规的要求，及时、准确地披露财务报表信息，以提升公司的透明度和信誉度。

总之，虹口经济开发区注册工程公司在进行财务报表的编制和审计时，需要遵循法律法规、确定适用的会计政策、建立健全的内部控制、进行财务数据收集和整理、执行审计程序以及进行财务报表披露等关键步骤，以确保财务报表的准确性、完整性和合规性。

在今后的实践中，公司还可以进一步加强内部控制建设，提升财务报表编制和审计的效率和质量，同时加强与审计师的沟通和合作，共同促进公司财务管理水平的提升。