一、充分利用税收优惠政策

1、虹口经济开发区为吸引投资和促进经济发展而实施了一系列税收优惠政策，包括减免、退税等。公司应该深入了解并合理利用这些政策，例如，根据相关规定申请增值税减免或退税。

2、某些行业或项目可能享受特殊的增值税政策，比如高新技术企业、科技型中小企业等。在符合条件的情况下，公司可以申请认定，并享受相应的税收优惠。

3、对于涉及技术转让、技术服务等方面的业务，可以通过合理设计合同结构，将增值税负担降到最低，例如采用分开计价的方式，避免将增值税计入合同总价。

4、此外，还可以通过拆分业务、合理规划生产流程等方式，降低应纳增值税额，进而减轻公司的税收负担。

5、需要注意的是，公司在享受税收优惠政策时，应当遵守相关法律法规，确保申报资料的真实性和合规性，以免引发税务风险。

二、优化供应链管理

1、合理规划供应链结构，优化供应商选择，有选择地与享受税收优惠的供应商合作，以便在采购环节降低增值税负担。

2、加强与供应商的沟通与协作，优化订单管理、物流配送等环节，避免物流中断和库存积压，减少因存货滞销而导致的增值税成本。

3、通过采用先进的信息技术手段，实现供应链的数字化管理和智能化运营，提高供应链效率，降低运营成本，从而间接降低增值税负担。

4、对于跨境采购和销售的公司，应当合理规划进出口业务，充分利用相关的贸易政策和税收优惠，降低跨境交易中的增值税成本。

5、在供应链管理过程中，还应重视风险管理，及时应对市场波动和政策变化，减少因外部环境因素而导致的税收风险。

三、加强财务管理和税务筹划

1、建立健全的财务管理制度，加强内部审计和风险控制，确保财务数据的准确性和完整性，避免因错误申报或遗漏而导致的税务风险。

2、定期进行财务分析和预测，及时发现经营风险和税务风险，采取有效措施加以应对，确保公司的税务合规和稳健经营。

3、积极开展税务筹划，合理安排资金运作和利润分配，最大限度地利用税收优惠政策和减免政策，降低公司的税收负担。

4、根据公司业务特点和经营需求，灵活运用各类税收工具和税收政策，制定适合公司的税务筹划方案，实现税负优化和风险控制。

5、加强与税务机关的沟通和协商，及时了解税收政策和法规的变化，积极配合税务检查和审计工作，减少税务纠纷和争议。

四、加强员工培训和管理

1、加强员工税法培训，提高员工对税收政策和税务规定的理解和遵守意识，减少因员工操作失误而引发的税务风险。

2、建立健全的内部控制制度，规范企业内部管理和操作流程，防范和减少税务风险，确保公司的税收合规和稳健经营。

3、加强对员工的绩效考核和监督管理，建立激励和约束机制，引导员工依法合规经营，有效降低税收风险。

4、建立健全的税务管理团队，配备专业税务人员，加强对税收政策和法规的研究和解读，提供专业的税务咨询和筹划服务。

5、加强与外部税务顾问和律师的合作，及时获取最新的税收信息和法律法规变化，为公司的税务决策提供专业支持和建议。

综上所述，公司在虹口经济开发区合法减少增值税负担的途径有很多，可以通过充分利用税收优惠政策、优化供应链管理、加强财务管理和税务筹划、加强员工培训和管理等多种方式来实现。公司应当根据自身的实际情况和经营需求，制定合理的税务策略和管理措施，确保税收合规和经营稳健，为实现可持续发展奠定坚实的基础。