在虹口经济开发区注册船舶公司需要严格遵守环保法规，以确保海洋生态环境的可持续发展和公司的合规经营。以下将详细介绍在注册船舶公司时需要遵守的环保法规。

一、废水处理

船舶公司在虹口经济开发区注册后，必须符合相关废水处理要求。这包括船舶上产生的污水、油污水等的处理和排放标准。公司需要建立合适的废水处理设施，确保不会对周边海域造成污染。同时，需要定期进行废水排放监测，并按照规定报告相关数据。

另外，还需要遵守国际海事组织（IMO）制定的《国际防止船舶污染公约》（MARPOL）关于废水排放的规定，严格控制船舶排放的污水成分和浓度。

二、废气排放

船舶公司在注册后，需要关注船舶的废气排放问题。应当符合国家和地方的大气污染防治法规，采取有效措施减少船舶燃油燃烧产生的废气排放量。可以通过安装尾气处理装置、选用低硫燃油等方式来降低排放。

同时，公司需要进行定期的废气排放监测，确保船舶的排放符合相关标准，并及时采取修正措施。

三、垃圾处理

船舶公司注册后，需要制定科学的垃圾处理方案，包括固体垃圾、化学品废弃物等的处理和处置方式。应当遵守《海洋环境保护法》等相关法律法规，确保船舶在航行过程中产生的垃圾不会直接排放至海洋中。

公司应当配备相应的垃圾处理设施，如压缩机、焚烧炉等，对船上产生的垃圾进行分类、处理和妥善处置。

四、涂料及防污处理

船舶在注册后，需要注意船体的涂料使用和防污处理。应当选择环保型的船体涂料，减少有害物质的挥发和污染。同时，可以采取物理、化学等多种手段，对船体进行防污处理，降低海洋生物附着和生长的可能性。

此外，还应当遵守国际海事组织颁布的《国际防止船舶污染公约》附件Ⅰ关于船体防污的相关规定，确保船舶的防污措施符合国际标准。

综上所述，船舶公司在注册虹口经济开发区需严格遵守相关环保法规，包括废水处理、废气排放、垃圾处理和涂料及防污处理等方面的规定。只有积极履行环保责任，才能实现可持续发展，保护海洋生态环境。