在虹口经济开发区注册公司，需要注意的税务问题是创业者在开展业务时必须认真考虑和遵守的事项。税务政策的变化和法规的更新可能会对公司的经营产生直接影响，因此了解税务问题并采取相应的措施至关重要。

一、税收申报与缴纳

在虹口经济开发区注册公司后，第一个需要重点关注的税务问题是税收申报与缴纳。公司需要按时向税务机关提交各类税收申报表，如增值税、企业所得税等。此外，及时足额地缴纳税款也是公司应尽的义务，以免拖欠税款导致滞纳金和罚款的产生。

在申报与缴纳过程中，公司应当注意及时了解相关税收政策的变化，确保申报的准确性和合规性，避免因疏忽导致的税务风险。

二、税务优惠政策

虹口经济开发区可能会针对不同类型的企业推出税务优惠政策，以鼓励企业发展和投资。创业者注册公司时，应当详细了解当地的税收优惠政策，例如对新设立企业的减免税政策、对高新技术企业的税收优惠等。

同时，公司应当合理利用税收优惠政策，以降低企业成本、提升竞争力，但也要注意遵守相关的规定和限制，避免因误用或滥用而带来的法律风险。

三、跨境业务税务合规

如果公司在虹口经济开发区从事跨境业务，就需要特别关注跨境税务合规的问题。这包括了解国际税收协定、跨境货物和服务交易的税收政策等方面。

在开展跨境业务时，公司必须确保遵守相关的税收法规，如申报海关进出口税收、合规支付跨境利润转移定价等，以避免因不合规而引发的税务风险和罚款。

四、税务审计与风险防范

公司注册后，可能会面临税务审计的风险。税务机关有权对纳税企业进行定期或不定期的税务审计，以核实企业的税收申报情况和合规性。

为了降低税务审计的风险，公司应当建立健全的内部税务管理制度，确保税收申报的真实性和完整性。此外，及时纠正可能存在的税务违规行为，并积极配合税务机关的审计工作，以减少不必要的纠纷和处罚。

综上所述，注册公司在虹口经济开发区时，需要重点关注税务申报与缴纳、税务优惠政策、跨境业务税务合规和税务审计与风险防范等问题。创业者应当深入了解相关税收政策和法规，积极遵守税务法规，合理利用税收优惠政策，以确保公司的合规经营和可持续发展。